################################################################################ ### ### ### RUNNING gff2aplot ### ### ### ### User: lopep ### ### Date: Fri Jun 6 18:29:14 2003 ### ### Perl: v5.8.0 ### ################################################################################ ################################################################################ ### SETTING DEFAULTS ### ################################################################################ ################################################################################ ### CHECKING COMMAND-LINE OPTIONS ### ################################################################################ ### ### Validating INPUT FILENAMES ### ###---> "KCRB.hs.gff" exists, including as Input File. ###---> "KCRB.mm.gff" exists, including as Input File. ###---> "KCRB.GT.hs-mm.gff" exists, including as Input File. ###---> "KCRB.AG.hs-mm.gff" exists, including as Input File. ### ### Validating CUSTOM FILENAMES ### ###---> ".gff2aplotrc" NOT FOUND, skipping!!! ###---> "GT-AG.rc" exists, including as Custom File. ###---> "GT-AG_blend.rc" exists, including as Custom File. ### ### Checking COMMAND-LINE Options ### .... [000004] ### ### Checking Custom Variables SET by COMMAND-LINE ### ################################################################################ ### COMMAND-LINE OPTIONS CHECKED ### ### 0 wallclock secs ( 0.03 usr + 0.00 sys = 0.03 CPU) ### ################################################################################ ### ################################################################################ ### COMMAND-LINE CHECKED ### ### 0 wallclock secs ( 0.00 usr + 0.00 sys = 0.00 CPU) ### ################################################################################ ### ################################################################################ ### READING CUSTOM FILES ### ################################################################################ ### ### Reading Customization Parameters from "GT-AG.rc" ### .*..LLLLLLLLLL.*G.*FFFFFFFF.F.FF [000032] ### ### Reading Customization Parameters from "GT-AG_blend.rc" ### *LL [000003] ################################################################################ ### CUSTOM FILES LOADED ### ### 0 wallclock secs ( 0.01 usr + 0.00 sys = 0.01 CPU) ### ################################################################################ ### ################################################################################ ### MAPPING CUSTOMIZATION INPUTS TO MAIN VARS ### ################################################################################ ################################################################################ ### VALUES SET for MAIN VARS ### ### 0 wallclock secs ( 0.01 usr + 0.00 sys = 0.01 CPU) ### ################################################################################ ### ################################################################################ ### PARSING INPUT GFF RECORDS ### ################################################################################ ### ### Reading GFF records from "KCRB.hs.gff" ### XXXXXXXXXX [000010] ### ### Reading GFF records from "KCRB.mm.gff" ### XXXXXXXXXX [000010] ### ### Reading GFF records from "KCRB.GT.hs-mm.gff" ### OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000050] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000100] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000150] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000200] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000250] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000300] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000350] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000400] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000450] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000500] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000550] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000600] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000650] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000700] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000750] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000800] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000850] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000900] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000950] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001000] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001050] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001100] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001150] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001200] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001250] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001300] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001350] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001400] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001450] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001500] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001550] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001600] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001650] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001700] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001750] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001800] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001850] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001900] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001950] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002000] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002050] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002100] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002150] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002200] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002250] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002300] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002350] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002400] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002450] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002500] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002550] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002600] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002650] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002700] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002750] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002800] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002850] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002900] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002950] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003000] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003050] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003100] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003150] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003200] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003250] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003300] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003350] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003400] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003450] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003500] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003550] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003600] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003650] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003698] ### ### Reading GFF records from "KCRB.AG.hs-mm.gff" ### OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000050] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000100] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000150] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000200] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000250] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000300] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000350] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000400] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000450] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000500] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000550] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000600] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000650] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000700] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000750] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000800] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000850] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000900] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [000950] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001000] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001050] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001100] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001150] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001200] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001250] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001300] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001350] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001400] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001450] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001500] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001550] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001600] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001650] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001700] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001750] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001800] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001850] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001900] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [001950] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002000] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002050] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002100] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002150] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002200] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002250] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002300] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002350] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002400] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002450] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002500] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002550] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002600] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002650] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002700] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002750] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002800] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002850] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002900] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [002950] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003000] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003050] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003100] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003150] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003200] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003250] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003300] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003350] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003400] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003450] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003500] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003550] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003600] OOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOOO [003639] ################################################################################ ### DATA LOADED ### ### 8 wallclock secs ( 6.86 usr + 0.35 sys = 7.21 CPU) ### ################################################################################ ### ################################################################################ ### SETTING CUSTOM VALUES TO GFF ELEMENTS ### ################################################################################ ################################################################################ ### VALUES SET for GFF ELEMENTS ### ### 3 wallclock secs ( 3.65 usr + 0.01 sys = 3.66 CPU) ### ################################################################################ ### ################################################################################ ### SORTING ELEMENTS BY ACCEPTOR (START) ### ################################################################################ *- Sorting ANNOTATION DATA | *- Sequence: HSCKBG | | *- Source: embl | | | *- Strand: + | | | | *- Group: HSCKBG | | | | | Sorted 10 elements. | | | | `Sorted 1 groups. | *- Sequence: MMCRKNB | | *- Source: embl | | | *- Strand: + | | | | *- Group: MMCRKNB | | | | | Sorted 10 elements. | | | | `Sorted 1 groups. *- Sorting ALIGNMENT DATA | *- Sequence: HSCKBG:MMCRKNB | | *- Source: ssitesim | | | *- Strand: ++ | | | | *- Group: 0.91 | | | | | Sorted 11 elements. | | | | *- Group: 0.2 | | | | | Sorted 2171 elements. | | | | *- Group: 0.64 | | | | | Sorted 10 elements. | | | | *- Group: 0.27 | | | | | Sorted 601 elements. | | | | *- Group: 0.09 | | | | | Sorted 1450 elements. | | | | *- Group: 0.82 | | | | | Sorted 4 elements. | | | | *- Group: 0.45 | | | | | Sorted 115 elements. | | | | *- Group: 1 | | | | | Sorted 13 elements. | | | | *- Group: 0.4 | | | | | Sorted 1090 elements. | | | | *- Group: 0.36 | | | | | Sorted 291 elements. | | | | *- Group: 0.8 | | | | | Sorted 58 elements. | | | | *- Group: 0.73 | | | | | Sorted 4 elements. | | | | *- Group: 1.00 | | | | | Sorted 2 elements. | | | | *- Group: 0.6 | | | | | Sorted 366 elements. | | | | *- Group: 0.18 | | | | | Sorted 1123 elements. | | | | *- Group: 0.55 | | | | | Sorted 28 elements. | | | | `Sorted 16 groups. ################################################################################ ### ELEMENTS SORTED ### ### 1 wallclock secs ( 1.06 usr + 0.01 sys = 1.07 CPU) ### ################################################################################ ### ################################################################################ ### SETTING PAGE LAYOUT ### ################################################################################ ###---> Page size set to "a4" ( 595 x 842 )... ###---> Setting plot AXES: ### ALIGNMENT "HSCKBG:MMCRKNB" was found. PLOTTING IT... ### X-SEQUENCE "HSCKBG" was found. PLOTTING IT... ### Y-SEQUENCE "MMCRKNB" was found. PLOTTING IT... ###---> SEQUENCE BOUNDARIES selected for this plot: ### X : 0 to 4200 ### Y : 0 to 4600 ###---> SEQUENCE ZOOM is not enabled for this plot... ###---> NO ZOOM AREA was selected for this plot... ###---> SCORE BOUNDARIES selected for this plot: ### ALIGNMENT: 0 to 1 ### PERCENT box: 0.0 to 1.0 ###---> TICKMARKS were set: ### Nucleotide-Scale: Major step 1000 - Minor step 200 ### Score-Scale: Major step 0.25 - Minor step 0.05 ###---> X/Y scale settings are: ### XY-RATIO is not taken into account for this plot ... ### Are X/Y axes going to have same length ? YES ################################################################################ ### PAGE LAYOUT SET for CURRENT PLOT ### ### 0 wallclock secs ( 0.00 usr + 0.00 sys = 0.00 CPU) ### ################################################################################ ### ################################################################################ ### WRITING POSTSCRIPT TO STDOUT ### ################################################################################ ###---> PostScript Header DONE... ###---> PostScript Colors Table SET... ###---> PostScript Page-formats Table SET... ###---> PostScript Variables SET... ###---> PostScript Functions SET... ###---> Writting PostScript Page: ### + APLOT-BOX section : ### + drawing X-sequence annotation (HSCKBG)... ### + drawing X-sequence ribbons... ### + drawing Y-sequence annotation (MMCRKNB)... ### + drawing Y-sequence ribbons... ### + drawing X-sequence ribbons outline... ### + drawing Y-sequence ribbons outline... ### + drawing alignment features (HSCKBG:MMCRKNB)... ### + APLOT-BOX section DONE... ### + PERCENT-BOX section : ### + drawing X-sequence ribbons... ### + drawing X-sequence ribbons outline... ### + drawing alignment features (HSCKBG:MMCRKNB)... ### + PERCENT-BOX section DONE... ###---> PostScript Page FINISHED... ################################################################################ ### WRITING POSTSCRIPT FINISHED ### ### 5 wallclock secs ( 3.95 usr + 0.04 sys = 3.99 CPU) ### ################################################################################ ### ################################################################################ ### gff2aplot HAS FINISHED ### ### [ 17 wallclock secs (15.58 usr + 0.41 sys = 15.99 CPU) ] ### ################################################################################